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16S/18S/ITS等擴增子測序服務

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16S/18S/ITS等擴增子測序服務

產品描述信息

  擴增子測序通過對一定長度的PCR擴增子進行測序,研究環境樣品中的微生物多樣性,主要包括16S rDNA測序(用于細菌或古菌多樣性研究)、18S rDNA測序和ITS測序(用于真菌或微小動植物等多樣性研究)等。通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS序列的某一或某幾個高度變異區,采用Illumina MiSeq高通量測序平臺將目的區域正反向讀通,通過檢測目的區域的序列變異和豐度,對環境樣本物種分類及豐度、種群結構、系統進化、群落距離等方面信息進行分析。探討微生物多樣性,對于研究微生物與環境的關系、環境治理和微生物資源利用有著重要的理論和現實意義   

產品詳細信息

   研究所有環境樣品(包括土壤、水體和腸道等環境)中微生物物種分類、群落結構、多樣性、差異微生物和樣品間群落比較等。

l準確性高:從堿基保守水平測定,真實反映物種情況;

l鑒定高效與傳統鑒定方法相比,具有通量大、產出數據多、速度更快;

l靈敏度高可以鑒定到低豐度微生物;

l低成本:需測序數據量少,檢測成本低;  

根據客戶需求定制研究方案和分析內容 。


生物信息數據分析內容

標準生物信息分析 

  • 測序結果質量評估

Ø測序數據統計

Ø序列拼接

Ø低質量序列過濾

ØOTU聚類

Ø物種分類

  • 群落結構及多樣性分析

Ø樣本群落組成分析

Ø多樣性指數

Ø稀釋曲線

ØShannon曲線

ØRank Abundance曲線

ØOTU分布Venn

ØHeatmap

ØPCA主成分分析

Ø差異微生物篩選

Ø差異微生物火山圖

高級生物信息分析

u系統發育樹

uNMDS分析

uRDA/CCA分析

特別聲明1.未列出的分析請咨詢技術支持。

        2.請以合同及實際分析內容為準。

個性化定制分析

 源宜基因會根據您的研究需求提供個性化的分析,共同協商后繪制定制化的分析圖表。

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